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宏基因组测序
  • 技术优势
  • 服务内容
  • 服务说明
  • 个性化生物信息分析

 高密度、高覆盖度:获得贯穿整个基因组的高密度分子标记;

 精确度高:采用DISR生物信息分析流程,保证SNP的高准确性;

 性价比高:基于酶切简化的基因组DNA,数据量低,特别适合大样本量研究;

 快速高效:只需3-4个月即可完成大样本的图谱构建或群体进化研究。


一、测序数据基本分析


• RAD tag 产出数据统计;

 对于无参考基因组的物种,进行个体 RAD tag 聚类与群体 RAD tag 聚类;

• 对于有参考基因组的种,与参考基因组进行比对;

 SNP检测、注释及统计;


二、个性化生物信息分析——遗传图谱构建;


• 基因分型;

• 遗传图谱构建;

• QTL 定位(需提供表型数据);

• 遗传图谱整合(需提供同一作图群体原图谱数据);

• 高级信息分析——群体进化研究;

• 群体进化树分析(Phylogeny tree);

• 群体结构分析(Structure);

• 群体主要成分分析(PCA);

• 连锁不平衡分析(LD)。


可结合客户的需求,协商确定信息分析服务内容。



一、样本要求


样品类型:DNA样品,无降解或轻微降解,无污染;

样品需求量(单次):≥ 1 μg(单次),如果需要多次制备样品,则需要样品总量=制备样品次 ×1 μg

样品浓度:≥ 25 ng/μL

群体分析材料选择推荐:物种内亚群的划分要比较明确,相同亚群内的个体要有一定的代表性,选择材料将

响到群体选择分析的结果;

构建遗传图谱推荐100个样本以上。


二、项目运转周期

      标准流程的运转周期约为60个工作日。


三、项目合格指标

      产生不低于合同规定的clean data


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